| # | Nama | Akreditasi |
|---|---|---|
| 1 | 69893111 - SMTK PELITA KANAAN | C |
| 2 | P9934874 - PKBM Alfa Omega | B |
| 3 | 30400461 - SMAS DARMA BAKTI | B |
| 4 | 30402827 - SMAS KATOLIK HENRICUS LEVEN | C |
| 5 | 30400462 - SMA NEGERI 1 MALINAU | A |
| 6 | 69786905 - SLB NEGERI MALINAU | A |
| 7 | 30402834 - SMK NEGERI 2 MALINAU | A |
| 8 | 30402830 - SMAS PEMBANGUNAN | Tidak Terakreditasi |
| 9 | 70045544 - MA Al Khairaat Malinau |